Il doppio del Japan Open Tennis Championships 2009 è stato un torneo di tennis facente parte dell'ATP World Tour 2009.
Michail Južnyj e Miša Zverev erano i campioni uscenti, ma hanno scelto di non partecipare quest'anno.
Julian Knowle e Jürgen Melzer hanno battuto in finale Ross Hutchins e Jordan Kerr, con il punteggio di 6–2, 5–7, [10–8].
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